Confina a nord-ovest con il Molise, a ovest con la Campania e la Basilicata ed è bagnata dal mare Adriatico a est e nord e dal mar Ionio a sud.

Comprende le province di Bari (capoluogo), Foggia, Barletta-Andria-Trani, Taranto, Brindisi e Lecce, la Puglia è la regione più orientale d'Italia: la località più ad est è Punta Palascìa (Otranto), distante 78 chilometri dall'isola greca di Fanò e dalle coste dell'Albania.